もともと生えている毛を除去して体に影響はないのでしょうか？

大きな影響はございません。

毛には、肌を外気から保護したり、体温を維持したりする役割があります。

しかし、現在は衣類の着用によって肌が守られるほか、エアコンなどによる温度管理が可能なので、毛がなくても肌は守られる状態です。体温維持の観点ではレーザー照射により毛を処理しても体に影響はないと考えられます。